Počas storočia, ktoré nasledovali po vláde Mehmed II , dosiahla Osmanská ríša vrchol svojej moci a bohatstva. Nové výboje rozšírili jej doménu aj do strednej Európy a do celej arabskej časti starého islamského kalifát a bola vytvorená nová zmes politických, náboženských, sociálnych a ekonomických organizácií a tradícií, ktorá sa vyvinula v živý a pracovný celok.
Vláda bezprostredného nástupcu Mehmeda II., Bajezida II. (1481–1512), bola väčšinou obdobím odpočinku. Predchádzajúce výboje sa skonsolidovali a mnoho politických, hospodárskych a sociálnych problémov spôsobených Mehmedovou vnútornou politikou sa vyriešilo, čím sa získal pevný základ pre výboje sultánov 16. storočia. Hospodárske obmedzenia stanovené na financovanie kampaní Mehmeda II. Viedli počas posledného roku jeho vlády k virtuálnej občianskej vojne medzi hlavnými frakciami v Istanbule, spolia strana a turecká aristokracia . Bajezida dosadil na trón Janičiari kvôli ich vojenskej nadvláde nad hlavným mestom, zatiaľ čo jeho bojovnejší brat Cem utiekol do Anatólie, kde viedol vzburu pôvodne podporovanú tureckými hodnostármi. Bayezidovi sa podarilo dosiahnuť zmierenie tým, že im odhalil jeho v podstate mierumilovné plány, ktoré zhoršili spolia , takže Cem zostáva bez väčšej podpory. Cem potom v lete 1481 utiekol do exilu v Mamluk Sýrii. Nasledujúci rok sa vrátil s pomocou Mamlukovcov a posledného turkménskeho vládcu Karamana, ale jeho snaha získať podporu turkménskych nomádov zlyhala kvôli ich príťažlivosti pre Bayezidova heterodoxná náboženská politika. Cem zostal v emigrácii, najskôr na dvore križiackych rytierov na ostrove Rhodos a potom u pápeža v Ríme, až do svojej smrti v roku 1495. Európske snahy o jeho použitie ako na čele novej križiackej výpravy s cieľom znovu získať Istanbul boli neúspešné.
Medzitým však hrozba, že Cem môže viesť zahraničný útok, prinútila Bayezida sústrediť sa na vnútornú konsolidáciu. Väčšina majetku skonfiškovaného jeho otcom pre vojenské ťaženia bola obnovená pôvodným majiteľom. Rovné dane boli ustanovené okolo ríša aby všetky subjekty mohli plniť svoje povinnosti voči vláde bez toho, aby boli takým spôsobom narušenia a nespokojnosti, ktoré charakterizovali predchádzajúci režim. Obzvlášť dôležité bolo založenie avariz-i divaniye (vojnová truhlica) daň, ktorá počítala s mimoriadnymi výdavkami vojny bez zvláštnych konfiškácií alebo vysokých odvodov. Hodnota mincí sa obnovila a plány ekonomického rozmachu Mehmeda II sa konečne uskutočnili. Za týmto účelom boli tisíce Židov vyhnaných zo Španielska inkvizíciou v lete 1492 povzbudení k prisťahovaniu do Osmanskej ríše. Usadili sa najmä v Istanbul , Solún (dnešný Solún, Grécko ) a Edirne, kde sa pripojili k svojim koreligionistom v zlatom veku osmanského židovstva, ktoré trvalo až do 17. storočia, keď im osmanský úpadok a rastúca moc európskych diplomatov a obchodníkov umožnili presadzovať záujmy sultánových kresťanských subjektov na výdavky moslimov aj židov. Bayezid II. Dokončil úsilie, ktoré začal Mehmed II. S cieľom nahradiť vazalov priamou osmanskou správou v celej ríši. Prvýkrát centrálna vláda pravidelne fungovala s vyrovnaným rozpočtom. Z kultúrneho hľadiska Bayezid podnietil silnú reakciu proti christianizačným trendom predchádzajúceho polstoročia. Zdôrazňoval sa turecký jazyk a moslimské tradície. Pretože sám Bayezid bol mystik, priniesol do inštitúcií a praktík ortodoxného islamu mystické rituály a učenia, aby zabránil narastajúcej hrozbe heterodoxného šiʿizmu medzi kmeňmi východnej Anatólie.
Aj keď Bayezid uprednostňoval zachovanie mieru - aby mal čas a zdroje sústrediť sa na vnútorný rozvoj - bol prinútený k mnohým kampaniam potreby obdobia a požiadavky jeho bojovnejších spolia nasledovníkov. V Európe zavŕšil ríšu južne od riek Dunaja a Sávy dobytím Hercegoviny (1483) a mimo osmanskej kontroly ponechal iba Belehrad. Uhorský kráľ Matyáš Korvín (vládol v rokoch 1458–90) sa zaujímal hlavne o nastolenie svojej vlády nad Čechami a dohodol sa na mieri s Osmanmi (1484). Po jeho smrti prebiehali boje o dedičstvo na relatívne pokojnom fronte pre zvyšok Bayezidových bojov. panovať. Na severovýchod sultán zatlačil osmanské územie na sever od Dunaja, pozdĺž brehov Dunaja Čierne more , zachytávajúce v roku 1484 prístavy Kilia (dnešná Kiliya) a Akkerman (Bilhorod-Dnistrovskyy) - oba na terajšej Ukrajine - ktoré ovládali ústie Dunaja a Dnestra. Osmani tak ovládli hlavné podniky severoeurópskeho obchodu s Čiernym morom a Stredozemným morom. Pretože tieto pokroky boli v rozpore s ambíciami spoločnosti Poľsko , v rokoch 1483–84 nasledovala vojna, až kým presmerovanie Poľska pod hrozbou pižma pod Ivanom III. Veľkým neopustilo tento front pokojne ani po roku 1484.
Bajezid sa potom obrátil na východ, kde predchádzajúce výboje až k rieke Eufrat priviedli Osmany až k Mamlúckej ríši. Konflikt o kontrolu nad malým turkménskym kniežatstvom Dulkadir (Dhū al-Qadr), ktoré ovládlo veľkú časť Kilikie v južnej Anatólii a v horách na juh od jazera Van, a osmanská túžba podieľať sa na kontrole nad moslimskými svätými mestami Mekka a Medina viedli k prerušovaný vojny (1485–91). Táto vojna však nebola presvedčivá a Bayezidova nechuť k úsiliu odhodlať hlavné sily viedla k rozporom a kritika na strane jeho bojovnejších stúpencov. Bayezid tomu čelil tak, že sa pokúsil maďarským vnútorným rozbrojom bez úspechu dobyť Belehrad a prepadnúť sily vyslané do Sedmohradska, Chorvátska a Korutánska (dnešný štát Kärnten, Rakúsko ) boli otočené späť. V roku 1495 zomrel Cem a nastal nový mier s Maďarsko nechal Bayezidove ciele nenaplnené, a tak sa obrátil k Benátkam, svojmu ďalšiemu významnému európskemu nepriateľovi. Benátky povzbudzovali povstania proti sultánovi v Morea (Peloponéz) a v Dalmácii a Albánsku, ktoré postúpili Osmanom v roku 1479. Získali tiež kontrolu nad Cyprus (1489) a postavili tam veľkú námornú základňu, ktorú odmietlo povoliť Bayezidu použiť proti Mamlúkom. Benátčania namiesto toho použili Cyprus ako základňu pre pirátske útoky proti osmanskej lodnej doprave a pobrežiam, čím poukázali na strategický význam ostrova pre sultána. Bayezid tiež dúfal, že dobyje posledné benátske prístavy v Morea, aby vytvoril základne pre úplnú osmanskú námornú kontrolu nad východným Stredozemím. Všetky tieto ciele, s výnimkou kontroly nad Cyprom, sa dosiahli vo vojne s Benátkami, ktorá nasledovala v rokoch 1499 - 1503. Osmanská flotila sa prvýkrát objavila ako veľká stredomorská námorná mocnosť a Osmani sa stali integrálne súčasť európskych diplomatických vzťahov.
Bayezid nikdy nebol schopný využiť túto situáciu na nové dobytie Európy, pretože vzostup povstaní vo východnej Anatólii zabral počas posledných rokov jeho vlády veľkú pozornosť. Tam sa obnovil starý konflikt medzi autonómne , necivilizovaní nomádi a stabilná usadená blízkovýchodná civilizácia Osmanov. Turkménski nomádi odolali úsiliu Osmanov rozšíriť svoju administratívnu kontrolu na všetky časti ríše. V reakcii na ortodoxné moslimské zriadenie sa u nomádov vyvinula fanatická pripútanosť k vodcom mystických rádov súfijského a šíitského pôvodu. Najúspešnejšími z nich boli Ṣafavīs z Ardabīlu, mystický rád, ktorého turkménski členovia (nazývaní Kizilbash [Redheads] kvôli tomu, že používali červené pokrývky hlavy ako symbol svojej vernosti), sa tam prisťahovali z východnej Anatólie; dynastia Safavidov ustanovená rádom Ṣafavīho využila kombinované náboženské a vojenské odvolanie na dobytie väčšiny Iránu. Pod šachom Ismāʿīl I. (vládol v rokoch 1501–24) vyslali Safavovci misionárov do celej Anatólie a šírili správu o náboženskej kacírstve a politickej revolte nielen medzi kmeňovými národmi, ale aj medzi kultivujúcimi a niektorými mestskými živlami, ktorí sa v tomto hnutí začali stretávať. odpovede na ich vlastné problémy.
Výsledkom bola séria revolt, ktoré Bayezid nebol schopný alebo ochotný potlačiť kvôli svojej angažovanosti v Európe a kvôli svojim mystickým preferenciám ho naklonil k sympatizovaniu s náboženským posolstvom povstalcov. Nakoniec na začiatku 16. storočia prinútilo všeobecné anatolské povstanie Bayezida k veľkej výprave (1502–03), ktorá vytlačila Safavidov a mnohých ich turkménskych nasledovníkov do Iránu. Tam sa Safavovci zamerali na šírenie šiʿizmu ako prostriedku na získanie vernosti Peržanov voči a dynastie ovládli turkménski bojovníci. Ismāʿīl medzitým pokračoval v šírení svojho posolstva ako sufijského vodcu v Anatólii, čo viedlo k druhej veľkej vzbure jeho stúpencov proti Osmanom (1511). Všetky krivdy času sa spájali s v podstate náboženským povstaním proti ústrednej vláde a potlačiť ju mohla iba veľká výprava vedená veľkovezírom Ali Paşom. Podmienky, ktoré povstanie vyvolali, však zostali pre Bayezidovho nástupcu veľkým problémom. Nakoniec Bayezidova čoraz viac mystická a mierumilovná povaha viedla Janičiarov k tomu, aby ho zosadili z trónu v prospech jeho militantného a aktívneho syna Selima.
